Frederik I blev nok aldrig Luthersk. Men han var en snu politiker og begrænsede højadelens og bispernes magt, ved at spille deres egne interesser ud mod hinanden. De kompromiser de indgik, styrkede først og fremmest den verdslige del, men ikke mindst kongen selv, da godsejerne trods alt havde ofret noget for sagen.
Efter 1927 var den danske kirke næsten opdelt i to. Den katolske kirke som fortsat var landets officielle, styret af bisperne, og den lutherske der nu havde ret til at danne deres egne frimenigheder med lutherske præster og gudstjenesteordninger.
De efterfølgende 10 år blev en lang strid mellem katolikker og protestanter. Frederik I indførte reelt religionsfriheden for lutheranere i Danmark. Han beskyttede Hans Tausen som var fra Johanitterklosteret, og hvis stærkt lutheranske prædikener vakte røre. Under påskud af frit lejde, lokkede han Christian II til landet i 1532, men brød løftet og fængslede ham. Året efter døde Frederik I.[1]